Das Ernst-Haeckel-Haus in Jena ist ein Museum, das dem Leben und Werk von Ernst Haeckel, einem berühmten Zoologen, Philosophen und Darwinisten, gewidmet ist. Das Museum ist Teil der Friedrich-Schiller-Universität Jena und befindet sich in Haeckels ehemaligem Wohnhaus. Es dient als Hommage an Haeckels bedeutende Beiträge zur Zoologie und seinen Einfluss auf den Darwinismus.
Das Ernst-Haeckel-Haus befindet sich in Haeckels ehemaligem Wohnhaus, der zweistöckigen "Villa Medusa". Das Museum beherbergt eine Sammlung von Originalmanuskripten, Büchern, Briefen, Zeichnungen, Porträts, Fotografien und Drucken zu Haeckels Leben und Werk. Diese Exponate geben einen umfassenden Einblick in Haeckels wissenschaftliches und persönliches Leben.
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